Das EFLN legt großen Wert auf Ethik und Transparenz, die in unsere Aktivitäten integriert sind und seit Anfang der 2000er Jahre in der EU-Politik gefördert werden.
Die AEPL ist seit dem 19.09.2014 im Transparenzregister als gemeinnützige Vereinigung (VoG) nach belgischem Recht unter dem Namen "Europäische Freidenkervereinigung" eingetragen.
Die AEPL erscheint in der Kategorie "Nichtregierungsorganisationen, Plattformen und Netzwerke u. Ä." unter der Kennnummer 188133714462-27.